Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX1P78414 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX1P78414 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX1P78414 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX1P78414 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX1P78414 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX1P78414 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX1P78414 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX1P78414 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX1P78414 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX1P78414 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX1P78414 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX1P78414 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX1P78414 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX1P78414 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX1P78414 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX1P78414 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX1P78414 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX1P78414 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX1P78414 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX1P78414 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX1P78414 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX1P78414 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX1P78414 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX1P78414 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX1P78414 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX1P78414 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX1P78414 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX1P78414 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX1P78414 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX1P78414 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX1P78414 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX1P78414 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX1P78414 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX1P78414 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX1P78414 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX1P78414 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX1P78414 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX1P78414 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX1P78414 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX1P78414 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX1P78414 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX1P78414 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX1P78414 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX1P78414 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX1P78414 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX1P78414 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX1P78414 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX1P78414 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX1P78414 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX1P78414 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX1P78414 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX1P78414 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX1P78414 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX1P78414 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX1P78414 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX1P78414 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX1P78414 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX1P78414 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX1P78414 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX1P78414 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX1P78414 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX1P78414 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRX1P78414 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRX1P78414 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX1P78414 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX1P78414 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX1P78414 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX1P78414 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX1P78414 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX1P78414 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRX1P78414 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX1P78414 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX1P78414 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX1P78414 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX1P78414 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRX1P78414 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX1P78414 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX1P78414 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX1P78414 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX1P78414 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX1P78414 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRX1P78414 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX1P78414 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX1P78414 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX1P78414 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX1P78414 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX1P78414 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX1P78414 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX1P78414 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX1P78414 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRX1P78414 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX1P78414 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX1P78414 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX1P78414 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX1P78414 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX1P78414 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX1P78414 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRX1P78414 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRX1P78414 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms