Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCNA1P78396 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCNA1P78396 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCNA1P78396 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms