Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBBP68871 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBBP68871 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HBBP68871 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HBBP68871 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBBP68871 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBBP68871 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBBP68871 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBBP68871 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBBP68871 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBBP68871 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBBP68871 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBBP68871 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBBP68871 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBBP68871 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBBP68871 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBBP68871 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBBP68871 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HBBP68871 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HBBP68871 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HBBP68871 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HBBP68871 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HBBP68871 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HBBP68871 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HBBP68871 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HBBP68871 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HBBP68871 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HBBP68871 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HBBP68871 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HBBP68871 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HBBP68871 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HBBP68871 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HBBP68871 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HBBP68871 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HBBP68871 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HBBP68871 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HBBP68871 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HBBP68871 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HBBP68871 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HBBP68871 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HBBP68871 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HBBP68871 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HBBP68871 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HBBP68871 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HBBP68871 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HBBP68871 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HBBP68871 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HBBP68871 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HBBP68871 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HBBP68871 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HBBP68871 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HBBP68871 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HBBP68871 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HBBP68871 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HBBP68871 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HBBP68871 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HBBP68871 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HBBP68871 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HBBP68871 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HBBP68871 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HBBP68871 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HBBP68871 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HBBP68871 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HBBP68871 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HBBP68871 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HBBP68871 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HBBP68871 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HBBP68871 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HBBP68871 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HBBP68871 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HBBP68871 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HBBP68871 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HBBP68871 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HBBP68871 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HBBP68871 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HBBP68871 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HBBP68871 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HBBP68871 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HBBP68871 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HBBP68871 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HBBP68871 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HBBP68871 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HBBP68871 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HBBP68871 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HBBP68871 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HBBP68871 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HBBP68871 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HBBP68871 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HBBP68871 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HBBP68871 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HBBP68871 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HBBP68871 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HBBP68871 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HBBP68871 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HBBP68871 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HBBP68871 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HBBP68871 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HBBP68871 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HBBP68871 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HBBP68871 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms