Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL38P63173 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL38P63173 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL38P63173 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL38P63173 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL38P63173 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL38P63173 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL38P63173 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL38P63173 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL38P63173 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL38P63173 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL38P63173 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL38P63173 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL38P63173 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL38P63173 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL38P63173 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL38P63173 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL38P63173 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL38P63173 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL38P63173 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL38P63173 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL38P63173 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL38P63173 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL38P63173 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL38P63173 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL38P63173 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL38P63173 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL38P63173 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL38P63173 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL38P63173 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL38P63173 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL38P63173 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL38P63173 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL38P63173 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL38P63173 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL38P63173 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL38P63173 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL38P63173 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL38P63173 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL38P63173 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL38P63173 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL38P63173 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL38P63173 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL38P63173 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL38P63173 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL38P63173 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL38P63173 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL38P63173 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL38P63173 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL38P63173 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL38P63173 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL38P63173 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL38P63173 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL38P63173 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL38P63173 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL38P63173 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL38P63173 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL38P63173 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL38P63173 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL38P63173 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL38P63173 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL38P63173 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL38P63173 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL38P63173 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL38P63173 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL38P63173 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL38P63173 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL38P63173 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL38P63173 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL38P63173 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL38P63173 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL38P63173 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL38P63173 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL38P63173 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL38P63173 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL38P63173 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL38P63173 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL38P63173 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPL38P63173 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL38P63173 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL38P63173 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL38P63173 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL38P63173 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL38P63173 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPL38P63173 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL38P63173 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL38P63173 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL38P63173 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL38P63173 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL38P63173 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPL38P63173 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL38P63173 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL38P63173 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL38P63173 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL38P63173 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL38P63173 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL38P63173 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPL38P63173 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL38P63173 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPL38P63173 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms