Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HERVK_113P62684 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HERVK_113P62684 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HERVK_113P62684 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERVK_113P62684 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HERVK_113P62684 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HERVK_113P62684 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms