Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42P60953 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42P60953 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC42P60953 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42P60953 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42P60953 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42P60953 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42P60953 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC42P60953 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42P60953 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42P60953 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42P60953 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42P60953 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC42P60953 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42P60953 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42P60953 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42P60953 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42P60953 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42P60953 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42P60953 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42P60953 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42P60953 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC42P60953 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDC42P60953 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42P60953 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42P60953 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42P60953 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC42P60953 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42P60953 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42P60953 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42P60953 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42P60953 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC42P60953 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42P60953 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC42P60953 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC42P60953 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42P60953 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42P60953 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42P60953 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42P60953 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC42P60953 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42P60953 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42P60953 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42P60953 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42P60953 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42P60953 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42P60953 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42P60953 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42P60953 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC42P60953 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDC42P60953 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42P60953 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42P60953 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42P60953 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42P60953 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42P60953 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC42P60953 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42P60953 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42P60953 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42P60953 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42P60953 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42P60953 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42P60953 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42P60953 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42P60953 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42P60953 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42P60953 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42P60953 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42P60953 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42P60953 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42P60953 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42P60953 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42P60953 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42P60953 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42P60953 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42P60953 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42P60953 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42P60953 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42P60953 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42P60953 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42P60953 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42P60953 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42P60953 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42P60953 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42P60953 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42P60953 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42P60953 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42P60953 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42P60953 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42P60953 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42P60953 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42P60953 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42P60953 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42P60953 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42P60953 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42P60953 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42P60953 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42P60953 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42P60953 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42P60953 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms