Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEFSECP57772 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEFSECP57772 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EEFSECP57772 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms