Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP107P57740 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP107P57740 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP107P57740 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP107P57740 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP107P57740 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP107P57740 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP107P57740 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP107P57740 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP107P57740 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP107P57740 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP107P57740 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP107P57740 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP107P57740 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP107P57740 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP107P57740 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP107P57740 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP107P57740 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP107P57740 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP107P57740 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP107P57740 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP107P57740 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP107P57740 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP107P57740 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP107P57740 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP107P57740 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP107P57740 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP107P57740 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP107P57740 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP107P57740 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP107P57740 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP107P57740 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP107P57740 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP107P57740 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP107P57740 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP107P57740 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP107P57740 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP107P57740 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP107P57740 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP107P57740 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP107P57740 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP107P57740 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP107P57740 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP107P57740 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP107P57740 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP107P57740 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP107P57740 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP107P57740 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP107P57740 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP107P57740 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP107P57740 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP107P57740 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP107P57740 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP107P57740 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP107P57740 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP107P57740 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP107P57740 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP107P57740 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP107P57740 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP107P57740 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP107P57740 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP107P57740 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP107P57740 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP107P57740 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP107P57740 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP107P57740 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP107P57740 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP107P57740 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP107P57740 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP107P57740 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP107P57740 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP107P57740 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP107P57740 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP107P57740 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP107P57740 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP107P57740 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP107P57740 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP107P57740 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP107P57740 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP107P57740 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP107P57740 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP107P57740 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP107P57740 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP107P57740 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP107P57740 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP107P57740 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms