Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MFAP3P55082 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MFAP3P55082 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MFAP3P55082 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MFAP3P55082 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MFAP3P55082 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MFAP3P55082 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MFAP3P55082 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MFAP3P55082 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MFAP3P55082 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms