Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERFP50548 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERFP50548 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ERFP50548 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERFP50548 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERFP50548 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERFP50548 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERFP50548 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERFP50548 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERFP50548 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ERFP50548 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERFP50548 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERFP50548 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERFP50548 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERFP50548 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERFP50548 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERFP50548 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERFP50548 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERFP50548 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERFP50548 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERFP50548 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERFP50548 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERFP50548 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERFP50548 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERFP50548 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERFP50548 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERFP50548 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERFP50548 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERFP50548 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERFP50548 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERFP50548 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERFP50548 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERFP50548 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERFP50548 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERFP50548 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERFP50548 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERFP50548 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERFP50548 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERFP50548 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERFP50548 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERFP50548 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERFP50548 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERFP50548 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERFP50548 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERFP50548 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERFP50548 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERFP50548 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERFP50548 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERFP50548 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERFP50548 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERFP50548 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERFP50548 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERFP50548 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERFP50548 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERFP50548 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERFP50548 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERFP50548 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERFP50548 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERFP50548 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERFP50548 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERFP50548 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERFP50548 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERFP50548 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERFP50548 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERFP50548 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERFP50548 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERFP50548 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERFP50548 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERFP50548 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERFP50548 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERFP50548 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERFP50548 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERFP50548 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERFP50548 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERFP50548 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERFP50548 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERFP50548 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERFP50548 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERFP50548 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERFP50548 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERFP50548 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERFP50548 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERFP50548 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERFP50548 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERFP50548 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERFP50548 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERFP50548 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERFP50548 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERFP50548 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERFP50548 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERFP50548 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERFP50548 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERFP50548 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERFP50548 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERFP50548 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERFP50548 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERFP50548 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERFP50548 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERFP50548 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERFP50548 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms