Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP1P50238 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CRIP1P50238 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CRIP1P50238 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms