Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PSEN2P49810 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSEN2P49810 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PSEN2P49810 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms