Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA1P49639 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXA1P49639 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA1P49639 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms