Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPINT3P49223 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPINT3P49223 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPINT3P49223 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPINT3P49223 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms