Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABIFP47224 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABIFP47224 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RABIFP47224 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABIFP47224 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABIFP47224 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABIFP47224 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABIFP47224 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RABIFP47224 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABIFP47224 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABIFP47224 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABIFP47224 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RABIFP47224 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABIFP47224 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABIFP47224 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RABIFP47224 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABIFP47224 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABIFP47224 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RABIFP47224 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABIFP47224 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABIFP47224 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABIFP47224 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABIFP47224 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RABIFP47224 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RABIFP47224 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABIFP47224 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RABIFP47224 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABIFP47224 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RABIFP47224 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABIFP47224 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RABIFP47224 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABIFP47224 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABIFP47224 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABIFP47224 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RABIFP47224 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RABIFP47224 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABIFP47224 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABIFP47224 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABIFP47224 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RABIFP47224 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABIFP47224 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABIFP47224 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABIFP47224 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABIFP47224 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABIFP47224 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RABIFP47224 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RABIFP47224 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RABIFP47224 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABIFP47224 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABIFP47224 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABIFP47224 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABIFP47224 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABIFP47224 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABIFP47224 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABIFP47224 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RABIFP47224 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABIFP47224 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABIFP47224 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RABIFP47224 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABIFP47224 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RABIFP47224 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RABIFP47224 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABIFP47224 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABIFP47224 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RABIFP47224 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABIFP47224 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RABIFP47224 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABIFP47224 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABIFP47224 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABIFP47224 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RABIFP47224 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABIFP47224 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABIFP47224 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABIFP47224 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RABIFP47224 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABIFP47224 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABIFP47224 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABIFP47224 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABIFP47224 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABIFP47224 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABIFP47224 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RABIFP47224 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RABIFP47224 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABIFP47224 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABIFP47224 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABIFP47224 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABIFP47224 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABIFP47224 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABIFP47224 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABIFP47224 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RABIFP47224 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABIFP47224 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABIFP47224 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABIFP47224 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RABIFP47224 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABIFP47224 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABIFP47224 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABIFP47224 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RABIFP47224 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RABIFP47224 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms