Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL28P46779 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL28P46779 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL28P46779 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL28P46779 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL28P46779 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL28P46779 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL28P46779 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL28P46779 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL28P46779 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL28P46779 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL28P46779 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL28P46779 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL28P46779 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL28P46779 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL28P46779 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL28P46779 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL28P46779 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL28P46779 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL28P46779 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL28P46779 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL28P46779 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL28P46779 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL28P46779 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL28P46779 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL28P46779 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL28P46779 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL28P46779 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL28P46779 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL28P46779 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL28P46779 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL28P46779 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL28P46779 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL28P46779 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL28P46779 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL28P46779 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL28P46779 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL28P46779 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL28P46779 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL28P46779 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL28P46779 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL28P46779 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL28P46779 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL28P46779 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL28P46779 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL28P46779 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL28P46779 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL28P46779 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL28P46779 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL28P46779 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL28P46779 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL28P46779 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL28P46779 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL28P46779 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL28P46779 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL28P46779 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL28P46779 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL28P46779 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL28P46779 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL28P46779 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL28P46779 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL28P46779 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL28P46779 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL28P46779 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL28P46779 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL28P46779 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL28P46779 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL28P46779 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL28P46779 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL28P46779 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL28P46779 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL28P46779 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL28P46779 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL28P46779 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL28P46779 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL28P46779 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL28P46779 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL28P46779 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL28P46779 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL28P46779 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL28P46779 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL28P46779 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL28P46779 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL28P46779 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL28P46779 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL28P46779 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms