Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKN2BP42772 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2BP42772 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN2BP42772 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.3 ms