Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF4A3P38919 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF4A3P38919 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF4A3P38919 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF4A3P38919 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms