Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPN7P35236 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN7P35236 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN7P35236 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN7P35236 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms