Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA4P35212 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA4P35212 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA4P35212 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA4P35212 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA4P35212 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA4P35212 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA4P35212 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA4P35212 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA4P35212 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA4P35212 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA4P35212 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA4P35212 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA4P35212 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA4P35212 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA4P35212 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA4P35212 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA4P35212 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA4P35212 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA4P35212 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA4P35212 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA4P35212 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA4P35212 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA4P35212 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA4P35212 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA4P35212 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA4P35212 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA4P35212 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA4P35212 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA4P35212 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA4P35212 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA4P35212 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA4P35212 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA4P35212 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA4P35212 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA4P35212 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA4P35212 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA4P35212 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA4P35212 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA4P35212 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA4P35212 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA4P35212 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA4P35212 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA4P35212 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA4P35212 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA4P35212 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA4P35212 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA4P35212 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA4P35212 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA4P35212 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA4P35212 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA4P35212 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA4P35212 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA4P35212 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA4P35212 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA4P35212 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA4P35212 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA4P35212 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA4P35212 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA4P35212 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA4P35212 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA4P35212 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA4P35212 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA4P35212 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA4P35212 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA4P35212 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA4P35212 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA4P35212 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA4P35212 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA4P35212 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA4P35212 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA4P35212 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA4P35212 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA4P35212 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA4P35212 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA4P35212 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA4P35212 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA4P35212 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA4P35212 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA4P35212 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA4P35212 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA4P35212 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA4P35212 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA4P35212 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA4P35212 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA4P35212 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA4P35212 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA4P35212 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA4P35212 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA4P35212 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA4P35212 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA4P35212 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA4P35212 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA4P35212 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA4P35212 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJA4P35212 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA4P35212 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA4P35212 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA4P35212 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA4P35212 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms