Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDC2P34741 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDC2P34741 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDC2P34741 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDC2P34741 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDC2P34741 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDC2P34741 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDC2P34741 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDC2P34741 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDC2P34741 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDC2P34741 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDC2P34741 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDC2P34741 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDC2P34741 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDC2P34741 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDC2P34741 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDC2P34741 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDC2P34741 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDC2P34741 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SDC2P34741 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDC2P34741 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDC2P34741 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDC2P34741 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDC2P34741 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDC2P34741 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDC2P34741 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDC2P34741 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SDC2P34741 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDC2P34741 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDC2P34741 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDC2P34741 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDC2P34741 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDC2P34741 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDC2P34741 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDC2P34741 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDC2P34741 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDC2P34741 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDC2P34741 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDC2P34741 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDC2P34741 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDC2P34741 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDC2P34741 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDC2P34741 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDC2P34741 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDC2P34741 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDC2P34741 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDC2P34741 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDC2P34741 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDC2P34741 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDC2P34741 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDC2P34741 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SDC2P34741 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDC2P34741 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDC2P34741 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDC2P34741 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDC2P34741 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDC2P34741 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDC2P34741 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDC2P34741 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDC2P34741 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SDC2P34741 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDC2P34741 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDC2P34741 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDC2P34741 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDC2P34741 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SDC2P34741 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDC2P34741 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDC2P34741 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDC2P34741 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDC2P34741 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SDC2P34741 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDC2P34741 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDC2P34741 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDC2P34741 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDC2P34741 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDC2P34741 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDC2P34741 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDC2P34741 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDC2P34741 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDC2P34741 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDC2P34741 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDC2P34741 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDC2P34741 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDC2P34741 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SDC2P34741 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDC2P34741 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDC2P34741 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDC2P34741 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SDC2P34741 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDC2P34741 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDC2P34741 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDC2P34741 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDC2P34741 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDC2P34741 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDC2P34741 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDC2P34741 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDC2P34741 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDC2P34741 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDC2P34741 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDC2P34741 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms