Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNA8P32881 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNA8P32881 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNA8P32881 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 685.8 ms