Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD1CP29017 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CD1CP29017 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CD1CP29017 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD1CP29017 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CD1CP29017 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD1CP29017 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD1CP29017 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD1CP29017 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD1CP29017 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD1CP29017 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD1CP29017 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD1CP29017 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD1CP29017 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD1CP29017 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD1CP29017 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD1CP29017 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD1CP29017 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD1CP29017 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD1CP29017 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD1CP29017 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD1CP29017 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD1CP29017 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD1CP29017 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD1CP29017 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD1CP29017 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD1CP29017 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD1CP29017 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD1CP29017 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD1CP29017 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD1CP29017 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD1CP29017 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD1CP29017 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD1CP29017 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD1CP29017 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD1CP29017 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD1CP29017 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD1CP29017 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD1CP29017 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD1CP29017 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD1CP29017 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CD1CP29017 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD1CP29017 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD1CP29017 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD1CP29017 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD1CP29017 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD1CP29017 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD1CP29017 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CD1CP29017 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD1CP29017 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD1CP29017 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD1CP29017 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD1CP29017 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD1CP29017 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD1CP29017 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD1CP29017 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD1CP29017 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD1CP29017 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD1CP29017 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD1CP29017 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD1CP29017 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD1CP29017 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD1CP29017 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD1CP29017 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD1CP29017 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD1CP29017 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CD1CP29017 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CD1CP29017 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD1CP29017 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD1CP29017 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD1CP29017 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD1CP29017 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD1CP29017 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD1CP29017 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD1CP29017 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD1CP29017 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD1CP29017 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD1CP29017 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD1CP29017 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD1CP29017 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD1CP29017 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD1CP29017 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD1CP29017 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD1CP29017 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CD1CP29017 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD1CP29017 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD1CP29017 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD1CP29017 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD1CP29017 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD1CP29017 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD1CP29017 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD1CP29017 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD1CP29017 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD1CP29017 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD1CP29017 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD1CP29017 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CD1CP29017 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD1CP29017 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD1CP29017 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD1CP29017 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms