Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APEX1P27695 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APEX1P27695 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APEX1P27695 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX1P27695 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX1P27695 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX1P27695 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX1P27695 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX1P27695 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX1P27695 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX1P27695 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX1P27695 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX1P27695 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX1P27695 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX1P27695 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APEX1P27695 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX1P27695 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX1P27695 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APEX1P27695 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX1P27695 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX1P27695 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX1P27695 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX1P27695 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX1P27695 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APEX1P27695 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX1P27695 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX1P27695 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX1P27695 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX1P27695 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APEX1P27695 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX1P27695 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX1P27695 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APEX1P27695 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX1P27695 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX1P27695 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX1P27695 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX1P27695 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX1P27695 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX1P27695 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX1P27695 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX1P27695 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX1P27695 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX1P27695 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX1P27695 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX1P27695 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX1P27695 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX1P27695 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX1P27695 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX1P27695 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX1P27695 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX1P27695 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX1P27695 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX1P27695 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX1P27695 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX1P27695 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX1P27695 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APEX1P27695 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX1P27695 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX1P27695 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX1P27695 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX1P27695 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX1P27695 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX1P27695 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX1P27695 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX1P27695 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX1P27695 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX1P27695 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX1P27695 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX1P27695 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX1P27695 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX1P27695 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX1P27695 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX1P27695 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX1P27695 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX1P27695 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX1P27695 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APEX1P27695 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX1P27695 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APEX1P27695 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX1P27695 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX1P27695 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX1P27695 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX1P27695 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX1P27695 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX1P27695 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX1P27695 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX1P27695 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APEX1P27695 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX1P27695 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX1P27695 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX1P27695 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX1P27695 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APEX1P27695 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX1P27695 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX1P27695 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APEX1P27695 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APEX1P27695 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX1P27695 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX1P27695 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX1P27695 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms