Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MARK3P27448 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MARK3P27448 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MARK3P27448 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARK3P27448 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARK3P27448 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARK3P27448 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARK3P27448 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MARK3P27448 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MARK3P27448 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MARK3P27448 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARK3P27448 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARK3P27448 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARK3P27448 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARK3P27448 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARK3P27448 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MARK3P27448 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MARK3P27448 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARK3P27448 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARK3P27448 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARK3P27448 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARK3P27448 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARK3P27448 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARK3P27448 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARK3P27448 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARK3P27448 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARK3P27448 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARK3P27448 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARK3P27448 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MARK3P27448 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARK3P27448 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARK3P27448 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARK3P27448 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARK3P27448 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARK3P27448 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARK3P27448 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARK3P27448 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARK3P27448 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARK3P27448 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARK3P27448 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARK3P27448 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARK3P27448 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARK3P27448 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARK3P27448 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARK3P27448 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARK3P27448 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARK3P27448 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARK3P27448 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARK3P27448 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARK3P27448 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARK3P27448 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARK3P27448 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARK3P27448 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MARK3P27448 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARK3P27448 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARK3P27448 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MARK3P27448 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MARK3P27448 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MARK3P27448 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MARK3P27448 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARK3P27448 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARK3P27448 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARK3P27448 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARK3P27448 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARK3P27448 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARK3P27448 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARK3P27448 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARK3P27448 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARK3P27448 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARK3P27448 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARK3P27448 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARK3P27448 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MARK3P27448 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARK3P27448 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARK3P27448 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MARK3P27448 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARK3P27448 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARK3P27448 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MARK3P27448 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MARK3P27448 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MARK3P27448 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MARK3P27448 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MARK3P27448 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MARK3P27448 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MARK3P27448 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MARK3P27448 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms