Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD27P26842 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD27P26842 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD27P26842 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD27P26842 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD27P26842 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD27P26842 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD27P26842 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD27P26842 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD27P26842 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD27P26842 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD27P26842 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD27P26842 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD27P26842 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD27P26842 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD27P26842 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD27P26842 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD27P26842 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD27P26842 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CD27P26842 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD27P26842 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD27P26842 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD27P26842 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD27P26842 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD27P26842 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD27P26842 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD27P26842 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD27P26842 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD27P26842 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD27P26842 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CD27P26842 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CD27P26842 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD27P26842 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD27P26842 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD27P26842 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD27P26842 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD27P26842 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD27P26842 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD27P26842 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD27P26842 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD27P26842 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD27P26842 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD27P26842 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD27P26842 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD27P26842 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD27P26842 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD27P26842 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD27P26842 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD27P26842 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD27P26842 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD27P26842 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD27P26842 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD27P26842 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD27P26842 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD27P26842 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD27P26842 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD27P26842 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD27P26842 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD27P26842 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD27P26842 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD27P26842 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD27P26842 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CD27P26842 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD27P26842 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD27P26842 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD27P26842 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD27P26842 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD27P26842 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD27P26842 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD27P26842 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD27P26842 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD27P26842 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD27P26842 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD27P26842 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD27P26842 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD27P26842 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD27P26842 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD27P26842 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD27P26842 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD27P26842 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD27P26842 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD27P26842 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD27P26842 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD27P26842 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD27P26842 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD27P26842 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD27P26842 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD27P26842 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD27P26842 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD27P26842 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD27P26842 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD27P26842 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD27P26842 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CD27P26842 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD27P26842 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD27P26842 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD27P26842 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD27P26842 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD27P26842 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD27P26842 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms