Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME2P22392 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME2P22392 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME2P22392 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME2P22392 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME2P22392 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME2P22392 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME2P22392 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME2P22392 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME2P22392 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME2P22392 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME2P22392 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME2P22392 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME2P22392 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME2P22392 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME2P22392 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME2P22392 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME2P22392 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME2P22392 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME2P22392 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME2P22392 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME2P22392 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME2P22392 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P22392 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P22392 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P22392 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P22392 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P22392 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P22392 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P22392 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME2P22392 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME2P22392 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME2P22392 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME2P22392 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME2P22392 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME2P22392 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME2P22392 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME2P22392 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME2P22392 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME2P22392 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NME2P22392 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P22392 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P22392 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P22392 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P22392 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P22392 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P22392 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P22392 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P22392 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NME2P22392 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME2P22392 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME2P22392 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME2P22392 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME2P22392 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NME2P22392 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NME2P22392 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME2P22392 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME2P22392 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NME2P22392 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME2P22392 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME2P22392 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NME2P22392 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME2P22392 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NME2P22392 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NME2P22392 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME2P22392 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME2P22392 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME2P22392 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NME2P22392 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME2P22392 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME2P22392 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME2P22392 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NME2P22392 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME2P22392 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME2P22392 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME2P22392 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NME2P22392 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME2P22392 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME2P22392 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME2P22392 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME2P22392 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NME2P22392 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME2P22392 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NME2P22392 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P22392 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P22392 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P22392 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P22392 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P22392 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P22392 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P22392 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P22392 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NME2P22392 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P22392 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P22392 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P22392 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P22392 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P22392 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P22392 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NME2P22392 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms