Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYT1P21579 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYT1P21579 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYT1P21579 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYT1P21579 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYT1P21579 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYT1P21579 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYT1P21579 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYT1P21579 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYT1P21579 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYT1P21579 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT1P21579 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT1P21579 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT1P21579 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT1P21579 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT1P21579 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT1P21579 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT1P21579 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT1P21579 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT1P21579 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT1P21579 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT1P21579 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT1P21579 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT1P21579 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT1P21579 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYT1P21579 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYT1P21579 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYT1P21579 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYT1P21579 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYT1P21579 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYT1P21579 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYT1P21579 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYT1P21579 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT1P21579 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT1P21579 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT1P21579 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT1P21579 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT1P21579 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT1P21579 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT1P21579 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT1P21579 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT1P21579 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT1P21579 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT1P21579 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT1P21579 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYT1P21579 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYT1P21579 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYT1P21579 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SYT1P21579 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYT1P21579 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYT1P21579 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYT1P21579 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYT1P21579 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYT1P21579 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYT1P21579 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYT1P21579 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYT1P21579 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYT1P21579 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYT1P21579 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYT1P21579 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYT1P21579 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYT1P21579 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYT1P21579 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYT1P21579 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYT1P21579 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYT1P21579 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYT1P21579 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYT1P21579 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYT1P21579 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYT1P21579 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYT1P21579 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYT1P21579 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYT1P21579 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYT1P21579 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYT1P21579 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYT1P21579 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT1P21579 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT1P21579 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT1P21579 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT1P21579 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT1P21579 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT1P21579 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT1P21579 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT1P21579 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT1P21579 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYT1P21579 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYT1P21579 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYT1P21579 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYT1P21579 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYT1P21579 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYT1P21579 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT1P21579 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT1P21579 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT1P21579 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT1P21579 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT1P21579 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT1P21579 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT1P21579 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT1P21579 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT1P21579 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms