Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TRHP20396 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TRHP20396 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TRHP20396 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
TRHP20396 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
TRHP20396 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRHP20396 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRHP20396 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRHP20396 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRHP20396 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
TRHP20396 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRHP20396 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRHP20396 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRHP20396 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TRHP20396 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TRHP20396 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
TRHP20396 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
TRHP20396 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
TRHP20396 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TRHP20396 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
TRHP20396 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRHP20396 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRHP20396 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRHP20396 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
TRHP20396 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
TRHP20396 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
TRHP20396 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRHP20396 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRHP20396 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRHP20396 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRHP20396 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRHP20396 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRHP20396 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
TRHP20396 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
TRHP20396 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
TRHP20396 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
TRHP20396 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRHP20396 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRHP20396 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRHP20396 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRHP20396 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRHP20396 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRHP20396 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRHP20396 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TRHP20396 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
TRHP20396 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
TRHP20396 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
TRHP20396 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
TRHP20396 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
TRHP20396 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRHP20396 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRHP20396 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRHP20396 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRHP20396 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TRHP20396 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
TRHP20396 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRHP20396 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRHP20396 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRHP20396 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRHP20396 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRHP20396 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
TRHP20396 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
TRHP20396 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
TRHP20396 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
TRHP20396 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRHP20396 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRHP20396 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
TRHP20396 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRHP20396 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRHP20396 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
TRHP20396 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRHP20396 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
TRHP20396 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
TRHP20396 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
TRHP20396 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
TRHP20396 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRHP20396 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRHP20396 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRHP20396 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRHP20396 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRHP20396 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
TRHP20396 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRHP20396 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
TRHP20396 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
TRHP20396 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TRHP20396 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TRHP20396 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
TRHP20396 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRHP20396 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRHP20396 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRHP20396 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRHP20396 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
TRHP20396 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRHP20396 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRHP20396 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
TRHP20396 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRHP20396 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRHP20396 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRHP20396 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
TRHP20396 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms