Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRAP19793 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRAP19793 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RXRAP19793 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RXRAP19793 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RXRAP19793 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RXRAP19793 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RXRAP19793 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RXRAP19793 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RXRAP19793 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RXRAP19793 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRAP19793 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRAP19793 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRAP19793 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRAP19793 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RXRAP19793 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RXRAP19793 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RXRAP19793 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RXRAP19793 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RXRAP19793 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RXRAP19793 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RXRAP19793 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RXRAP19793 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RXRAP19793 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RXRAP19793 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RXRAP19793 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RXRAP19793 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RXRAP19793 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RXRAP19793 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RXRAP19793 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RXRAP19793 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RXRAP19793 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RXRAP19793 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RXRAP19793 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RXRAP19793 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRAP19793 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RXRAP19793 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRAP19793 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRAP19793 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RXRAP19793 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RXRAP19793 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RXRAP19793 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RXRAP19793 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RXRAP19793 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RXRAP19793 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RXRAP19793 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RXRAP19793 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RXRAP19793 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RXRAP19793 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RXRAP19793 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RXRAP19793 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RXRAP19793 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RXRAP19793 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RXRAP19793 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RXRAP19793 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RXRAP19793 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RXRAP19793 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RXRAP19793 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RXRAP19793 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RXRAP19793 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RXRAP19793 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RXRAP19793 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RXRAP19793 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RXRAP19793 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RXRAP19793 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RXRAP19793 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RXRAP19793 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RXRAP19793 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RXRAP19793 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RXRAP19793 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RXRAP19793 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RXRAP19793 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RXRAP19793 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RXRAP19793 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRAP19793 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRAP19793 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRAP19793 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRAP19793 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRAP19793 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRAP19793 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRAP19793 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRAP19793 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRAP19793 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RXRAP19793 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RXRAP19793 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RXRAP19793 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRAP19793 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRAP19793 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRAP19793 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRAP19793 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRAP19793 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RXRAP19793 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRAP19793 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRAP19793 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRAP19793 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRAP19793 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RXRAP19793 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXRAP19793 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXRAP19793 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXRAP19793 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms