Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERCC3P19447 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERCC3P19447 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERCC3P19447 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ERCC3P19447 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.1 ms