Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF4P18848 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF4P18848 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF4P18848 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF4P18848 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF4P18848 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATF4P18848 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATF4P18848 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATF4P18848 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF4P18848 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF4P18848 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF4P18848 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF4P18848 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF4P18848 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF4P18848 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF4P18848 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF4P18848 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF4P18848 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATF4P18848 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATF4P18848 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATF4P18848 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATF4P18848 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATF4P18848 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATF4P18848 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATF4P18848 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATF4P18848 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATF4P18848 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF4P18848 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF4P18848 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF4P18848 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF4P18848 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF4P18848 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF4P18848 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF4P18848 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATF4P18848 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATF4P18848 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATF4P18848 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATF4P18848 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF4P18848 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF4P18848 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATF4P18848 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF4P18848 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF4P18848 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF4P18848 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATF4P18848 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF4P18848 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF4P18848 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF4P18848 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF4P18848 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF4P18848 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF4P18848 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF4P18848 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF4P18848 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF4P18848 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF4P18848 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF4P18848 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF4P18848 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF4P18848 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF4P18848 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF4P18848 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF4P18848 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF4P18848 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF4P18848 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF4P18848 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF4P18848 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF4P18848 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF4P18848 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF4P18848 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF4P18848 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF4P18848 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF4P18848 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF4P18848 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF4P18848 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF4P18848 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF4P18848 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF4P18848 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF4P18848 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF4P18848 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF4P18848 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF4P18848 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF4P18848 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF4P18848 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF4P18848 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF4P18848 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF4P18848 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF4P18848 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATF4P18848 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF4P18848 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF4P18848 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATF4P18848 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF4P18848 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF4P18848 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF4P18848 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF4P18848 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF4P18848 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATF4P18848 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF4P18848 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF4P18848 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF4P18848 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATF4P18848 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms