Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB6P17509 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXB6P17509 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB6P17509 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB6P17509 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms