Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF3P15923 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF3P15923 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF3P15923 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF3P15923 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF3P15923 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF3P15923 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF3P15923 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF3P15923 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF3P15923 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF3P15923 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF3P15923 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF3P15923 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF3P15923 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF3P15923 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF3P15923 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF3P15923 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF3P15923 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCF3P15923 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TCF3P15923 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TCF3P15923 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF3P15923 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF3P15923 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF3P15923 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF3P15923 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF3P15923 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF3P15923 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF3P15923 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF3P15923 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF3P15923 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF3P15923 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF3P15923 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF3P15923 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF3P15923 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF3P15923 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF3P15923 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF3P15923 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCF3P15923 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCF3P15923 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TCF3P15923 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCF3P15923 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCF3P15923 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCF3P15923 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF3P15923 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF3P15923 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF3P15923 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF3P15923 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF3P15923 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF3P15923 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF3P15923 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF3P15923 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF3P15923 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF3P15923 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF3P15923 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF3P15923 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF3P15923 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF3P15923 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF3P15923 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF3P15923 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF3P15923 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF3P15923 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCF3P15923 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCF3P15923 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCF3P15923 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF3P15923 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF3P15923 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF3P15923 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCF3P15923 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TCF3P15923 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCF3P15923 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCF3P15923 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF3P15923 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF3P15923 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF3P15923 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF3P15923 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF3P15923 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF3P15923 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF3P15923 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF3P15923 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF3P15923 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF3P15923 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF3P15923 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF3P15923 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF3P15923 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF3P15923 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF3P15923 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF3P15923 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF3P15923 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF3P15923 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF3P15923 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF3P15923 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF3P15923 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF3P15923 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF3P15923 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF3P15923 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF3P15923 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF3P15923 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF3P15923 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF3P15923 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF3P15923 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms