Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXB2P14652 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB2P14652 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB2P14652 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms