Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
XRCC5P13010 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
XRCC5P13010 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
XRCC5P13010 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
XRCC5P13010 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
XRCC5P13010 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms