Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LINC00271P0C7V0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LINC00271P0C7V0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LINC00271P0C7V0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LINC00271P0C7V0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LINC00271P0C7V0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms