Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PKHD1P08F94 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PKHD1P08F94 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKHD1P08F94 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKHD1P08F94 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms