Protein–RNA interactions for Protein: P08173

CHRM4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM4P08173 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM4P08173 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM4P08173 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM4P08173 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM4P08173 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM4P08173 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM4P08173 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRM4P08173 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM4P08173 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM4P08173 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM4P08173 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM4P08173 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRM4P08173 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHRM4P08173 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRM4P08173 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM4P08173 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM4P08173 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms