Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEFMP07197 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NEFMP07197 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
NEFMP07197 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEFMP07197 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEFMP07197 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
NEFMP07197 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEFMP07197 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NEFMP07197 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
NEFMP07197 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEFMP07197 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NEFMP07197 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEFMP07197 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEFMP07197 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NEFMP07197 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEFMP07197 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NEFMP07197 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NEFMP07197 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NEFMP07197 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NEFMP07197 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NEFMP07197 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NEFMP07197 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NEFMP07197 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NEFMP07197 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NEFMP07197 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NEFMP07197 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NEFMP07197 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NEFMP07197 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NEFMP07197 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NEFMP07197 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEFMP07197 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NEFMP07197 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEFMP07197 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEFMP07197 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEFMP07197 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NEFMP07197 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NEFMP07197 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NEFMP07197 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NEFMP07197 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NEFMP07197 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NEFMP07197 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NEFMP07197 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NEFMP07197 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NEFMP07197 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NEFMP07197 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NEFMP07197 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NEFMP07197 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NEFMP07197 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NEFMP07197 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NEFMP07197 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NEFMP07197 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NEFMP07197 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NEFMP07197 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NEFMP07197 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NEFMP07197 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NEFMP07197 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEFMP07197 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEFMP07197 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEFMP07197 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEFMP07197 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NEFMP07197 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEFMP07197 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEFMP07197 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NEFMP07197 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEFMP07197 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEFMP07197 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEFMP07197 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEFMP07197 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEFMP07197 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NEFMP07197 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEFMP07197 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NEFMP07197 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEFMP07197 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NEFMP07197 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEFMP07197 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEFMP07197 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEFMP07197 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NEFMP07197 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
NEFMP07197 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NEFMP07197 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
NEFMP07197 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEFMP07197 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEFMP07197 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEFMP07197 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEFMP07197 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NEFMP07197 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEFMP07197 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEFMP07197 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEFMP07197 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NEFMP07197 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NEFMP07197 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEFMP07197 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NEFMP07197 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEFMP07197 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEFMP07197 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NEFMP07197 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEFMP07197 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NEFMP07197 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEFMP07197 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NEFMP07197 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms