Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPTA1P02549 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTA1P02549 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTA1P02549 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTA1P02549 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTA1P02549 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms