Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HLA-DQB1P01920 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HLA-DQB1P01920 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLA-DQB1P01920 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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