Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C6orf47O95873 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C6orf47O95873 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C6orf47O95873 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms