Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPNE6O95741 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPNE6O95741 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPNE6O95741 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPNE6O95741 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms