Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX3O95076 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALX3O95076 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX3O95076 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX3O95076 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALX3O95076 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX3O95076 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX3O95076 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX3O95076 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX3O95076 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX3O95076 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX3O95076 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALX3O95076 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX3O95076 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX3O95076 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX3O95076 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX3O95076 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX3O95076 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX3O95076 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX3O95076 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX3O95076 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALX3O95076 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX3O95076 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX3O95076 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX3O95076 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALX3O95076 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX3O95076 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX3O95076 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX3O95076 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX3O95076 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX3O95076 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX3O95076 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALX3O95076 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ALX3O95076 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX3O95076 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX3O95076 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX3O95076 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX3O95076 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALX3O95076 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX3O95076 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX3O95076 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX3O95076 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX3O95076 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX3O95076 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALX3O95076 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX3O95076 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX3O95076 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX3O95076 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX3O95076 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX3O95076 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX3O95076 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALX3O95076 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX3O95076 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX3O95076 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX3O95076 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX3O95076 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX3O95076 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALX3O95076 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX3O95076 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX3O95076 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALX3O95076 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX3O95076 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX3O95076 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX3O95076 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX3O95076 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX3O95076 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX3O95076 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX3O95076 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALX3O95076 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALX3O95076 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALX3O95076 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX3O95076 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX3O95076 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX3O95076 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX3O95076 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX3O95076 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX3O95076 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX3O95076 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX3O95076 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX3O95076 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX3O95076 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX3O95076 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX3O95076 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX3O95076 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX3O95076 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX3O95076 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX3O95076 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX3O95076 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX3O95076 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX3O95076 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX3O95076 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX3O95076 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX3O95076 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX3O95076 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX3O95076 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX3O95076 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX3O95076 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX3O95076 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX3O95076 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX3O95076 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms