Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24DO94855 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24DO94855 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24DO94855 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms