Protein–RNA interactions for Protein: O75973

C1QL1, C1q-related factor, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL1O75973 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QL1O75973 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QL1O75973 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QL1O75973 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 287.2 ms