Protein–RNA interactions for Protein: O75368

SH3BGRL, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRLO75368 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SH3BGRLO75368 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3BGRLO75368 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BGRLO75368 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRLO75368 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms