Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH16O75309 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH16O75309 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH16O75309 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH16O75309 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH16O75309 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH16O75309 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH16O75309 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH16O75309 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH16O75309 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH16O75309 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH16O75309 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH16O75309 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH16O75309 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH16O75309 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH16O75309 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH16O75309 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH16O75309 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH16O75309 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH16O75309 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH16O75309 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH16O75309 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH16O75309 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH16O75309 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH16O75309 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH16O75309 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH16O75309 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH16O75309 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH16O75309 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH16O75309 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH16O75309 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH16O75309 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH16O75309 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH16O75309 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH16O75309 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH16O75309 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH16O75309 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH16O75309 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH16O75309 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH16O75309 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH16O75309 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH16O75309 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH16O75309 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH16O75309 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH16O75309 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH16O75309 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH16O75309 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH16O75309 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH16O75309 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH16O75309 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH16O75309 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH16O75309 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH16O75309 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH16O75309 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH16O75309 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH16O75309 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH16O75309 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH16O75309 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH16O75309 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH16O75309 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH16O75309 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH16O75309 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH16O75309 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH16O75309 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH16O75309 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH16O75309 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH16O75309 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH16O75309 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH16O75309 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH16O75309 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH16O75309 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH16O75309 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH16O75309 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH16O75309 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH16O75309 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH16O75309 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH16O75309 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH16O75309 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH16O75309 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH16O75309 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH16O75309 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH16O75309 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH16O75309 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH16O75309 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH16O75309 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH16O75309 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH16O75309 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH16O75309 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH16O75309 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH16O75309 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH16O75309 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH16O75309 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH16O75309 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH16O75309 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH16O75309 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH16O75309 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH16O75309 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH16O75309 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH16O75309 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH16O75309 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms