Protein–RNA interactions for Protein: O75131

CPNE3, Copine-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE3O75131 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE3O75131 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE3O75131 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE3O75131 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE3O75131 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPNE3O75131 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPNE3O75131 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPNE3O75131 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE3O75131 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPNE3O75131 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE3O75131 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms